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高通量作物表型監(jiān)測:育種和精準(zhǔn)農(nóng)業(yè)發(fā)展的加速器

發(fā)布時間:2018-09-28 14:11:18  |  來源:中國網(wǎng)·中國發(fā)展門戶網(wǎng)  |  作者:郭慶華 楊維才 吳芳芳等  |  責(zé)任編輯:趙斌宇
關(guān)鍵詞:育種,高通量,表型,激光雷達(dá),無人機(jī)

當(dāng)前發(fā)展的瓶頸和未來方向

立足國家戰(zhàn)略需求

作為人口大國,我國不僅面臨著巨大的糧食缺口,同時也存在可用耕地減少,農(nóng)業(yè)灌溉用水利用率低,易發(fā)病蟲害等威脅糧食安全的問題。科技部在“十三五”科技創(chuàng)新規(guī)劃中明確將糧食豐產(chǎn)提質(zhì)增效、農(nóng)業(yè)面源污染防控等作為支撐引領(lǐng)現(xiàn)代農(nóng)業(yè)發(fā)展的重點研發(fā)任務(wù)。農(nóng)業(yè)需實現(xiàn)從“大水大肥”的粗放型模式,轉(zhuǎn)向依靠科技創(chuàng)新的新常態(tài)。盡管當(dāng)前我國在育種和估產(chǎn)等農(nóng)業(yè)相關(guān)工作中取得一定成效,但長遠(yuǎn)來看,對優(yōu)質(zhì)作物種質(zhì)資源的挖掘和利用仍相對較低。其主要原因之一是缺少對種質(zhì)資源的系統(tǒng)鑒定和深入研究,尤其是從種質(zhì)資源中挖掘優(yōu)良表型性狀及與之關(guān)聯(lián)的遺傳信息。作為基因型和環(huán)境變量互作的結(jié)果,表型監(jiān)測對于研究者剖析與產(chǎn)量和脅迫耐受性相關(guān)的遺傳學(xué)數(shù)量性狀,以及在精準(zhǔn)農(nóng)業(yè)背景下監(jiān)測田間變量以實時調(diào)控資源分配具有重要意義。為此,我們需要不斷提升種質(zhì)資源的鑒定與評價技術(shù)。通過搭建多尺度的作物表型高通量監(jiān)測平臺,可以實現(xiàn)從室內(nèi)到田間到大區(qū)域上的作物表型全生育期監(jiān)測,輔以環(huán)境變量實時監(jiān)控,建立起“基因型-表型-環(huán)境”的國家級數(shù)據(jù)庫。這不僅可以幫助育種學(xué)家進(jìn)一步深挖作物種質(zhì)資源,也可以協(xié)助農(nóng)學(xué)家實現(xiàn)高效的生長動態(tài)監(jiān)測,從而合理布控資源,提高資源有效利用率(圖4)。

平臺集成和算法研發(fā)

目前,國內(nèi)外已逐漸意識到表型監(jiān)測平臺對于育種和農(nóng)業(yè)發(fā)展的意義所在,國際上業(yè)已出現(xiàn)了一些比較成型的表型監(jiān)測系統(tǒng)。然而,當(dāng)前在表型平臺的使用中也面臨一些問題,如表型數(shù)據(jù)不能很好地與基因型數(shù)據(jù)匹配以及高通量表型監(jiān)測帶來的數(shù)據(jù)冗余等,這些都是新事物從產(chǎn)生到應(yīng)用再到成熟不可避免的事物發(fā)展過程。我們認(rèn)為,未來關(guān)于作物表型的研究將會持續(xù)受到關(guān)注,其主要發(fā)展或攻克方向包括以下?5?點。

高維度參數(shù)提取。作物精確的三維結(jié)構(gòu)的獲取依賴于激光雷達(dá)、RGB?相機(jī)等傳感器獲取的高維數(shù)據(jù),如何從高維數(shù)據(jù)中計算結(jié)構(gòu)特征,尤其是高維數(shù)據(jù)的特征提取、目標(biāo)探測以及分類分割等都有待進(jìn)一步的探討。

多尺度分析。當(dāng)前算法多集中于解決單一尺度表型參數(shù)提取,如何從不同尺度的數(shù)據(jù)中提取目標(biāo)作物的信息,如從群體中提取單株信息、從單株中提取器官(如根系、花穗)等特定性狀的方法十分欠缺。

多源數(shù)據(jù)融合。多源數(shù)據(jù)融合涉及兩個層面:一方面,研究者需將同一傳感器在不同時期獲取的數(shù)據(jù)進(jìn)行融合,從而實現(xiàn)全生育期性狀的動態(tài)監(jiān)測和分析。另一方面,針對多源傳感器獲取的信息,如何進(jìn)行不同維度、不同尺度的數(shù)據(jù)融合,尤其是在室內(nèi)獲取的、缺失坐標(biāo)信息的多源數(shù)據(jù),則是研究者進(jìn)行從形態(tài)到生理乃至機(jī)理的綜合型研究面臨的難題之一。

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