（節選）
本文由中國科學院生命科學和醫學學部咨詢組撰寫。文章共包括6部分內容。
一、新發和突發傳染病的危害
主要包括：1.嚴重威脅人類健康；2.嚴重制約經濟發展；3.嚴重影響社會穩定和國家安全，干擾日常社會秩序；4.人類未來的主要威脅。
二、影響新發和突發傳染病發生的因素
主要包括：1.社會及經濟發展的影響；2.科學技術發展的潛在負影響；3.人口結構與人類行為特征等因素的影響；4.病原體自身變異的影響；5.環境與氣候變化的影響。
三、國際社會防控傳染病流行的措施
主要包括：1.傳染病防控策略；2.傳染病防控體系；3.科技支撐體系。
四、我國面臨的傳染病防治形勢
我國是一個人口眾多的發展中國家，國民經濟正處于飛速發展階段。但我國在應對傳染病，特別是新發和突發傳染病方面仍面臨著嚴重的形勢：
1.艾滋病發病率急劇上升，危害日趨嚴重；
2.乙型病毒性肝炎的群體異常龐大，防治形勢嚴峻；
3.結核病、狂犬病、布病和血吸蟲病死灰復燃，卷土重來；
4.新發傳染病不斷涌現，人畜共患病受到廣泛關注；
5.我國傳染病種類多，多種傳染病流行猖獗；
6．傳染病導致醫療費用居高不下，政府、社會和家庭負擔沉重。
7.傳染病防治技術亟待提升。
五、我國傳染病防治體系現狀及存在問題
在近50多年與傳染病抗爭的過程中，我國傳染病防治體系不斷完善、壯大。
1.逐步完善各項法規，提供政策環境；
2.逐步完善疾控體系，提升應急能力；
3.重點強化研發體系，提供科技支撐；
4.注重人才隊伍建設，提供基礎保障；
5.存在問題
50多年來，我國在傳染病防控工作中積累了豐富的經驗，取得了突出的成績，但是仍存在許多亟待解決的問題。
第一，我國目前的疾病監測體系仍有待完善；
第二，我國的疾病檢出能力急需提高；
第三，尚未建立新發和突發病原的基礎生物信息數據庫、重要毒力和保護性抗原儲備庫；
第四，新發和突發病原的基礎研究相對薄弱；
第五，在基礎設施方面，對新發傳染病應急處置技術平臺的建設重視不夠；
第六，醫學、獸醫學科研人員缺乏協作溝通，對禽畜疫病的基礎研究投入不足。
第七，職能部門間缺乏合作。
六、關于加強新發和突發傳染病基礎研究的建議
1.制定新發與突發傳染病基礎研究的近、中與遠期的國家規劃，整合相關的計劃和項目，統籌規劃，合理部署，全面提升國家對新發與突發傳染病的整體防控能力。
2.加強專業人才隊伍培養，注重相關學科的資源配置，建立專門研究機構和加強專用基礎設施建設。
3.深入開展病原生態學與流行病學系統調查，建立與健全傳染病病原為主體的資源庫、基礎數據庫和相應的生物信息技術平臺， 為新發與突發傳染病的預測、預警和防控提供基礎支撐。
4.應用生命科學現代技術，通過多學科的交叉，開展以新發和突發病原體為主體的基礎研究及其致病機理研究，提高疾病的預測預警和防控能力。
當前，隨著生命科學研究領域的飛速發展，國際上對病原體的研究已進入一個以病原體基因組學為基礎的疾病診斷、預防和治療的新的時代。我國現階段在基礎研究中應加強的是:
（1）傳染病流行和變異模型及預測研究；
（2）人獸共患傳染跨種感染機制研究；
（3）病原體分子標識研究；
（4）病原體與宿主相互作用機制研究；
(5)中醫中藥治療傳染病機制的研究等等。
5.發展新技術新方法，提高基礎研究的原創水平，完善疾病監測與預警體系，以及對新發與突發傳染病的防治能力。
6.拓展新發與突發傳染病基礎研究的國際交流與合作，建立疾病監測與預警的全球化系統。（摘自中國科學院“科學發展報告”課題組撰寫的《2009科學發展報告》）
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